第零話 夢に沈むセカイ
His truth world

= 「  奇跡 の 始まり  」[End of Deception] 編 =

第壱話 使徒、襲来
Person who know the gospel

第弐話 見知らぬ、天井
Where are you? I am...

第参話 鳴らない、電話
Three transfers

第四話 雨、逃げ出した後
Because He still a Child.

第伍話 レイ、心のむこうに
What is Rei's heart?

第六話 決戦、第3新東京市
How is Rei's heart?

=  翼 の 終わり [End of His Wings] 編 =

第七話 人の造りしもの
It was Alone.

第八話 アスカ、来日
Asuka and two strikes!

第九話 瞬間、心、重ねて
Rely on Me.

第拾話 マグマダイバー
Dive into the Magma

第拾壱話 静止した闇の中で
The Day Tokyo-3 J,H,S-1 Stood Still

第拾弐話 奇跡の価値は
0.00001 is not Zero.

第拾参話 使徒、侵入
Minimum-size Computer Cracker

第拾四話 ゼーレ、魂の座
Weaving a Story:First Stage

=   ココロ の 終わり  [End of One's Senses] 編 =

第拾伍話 嘘と沈黙
Spy, Pilots and the lie

第拾六話 死に至る病、そして
I Don't think so.

第拾七話 四人目の適格者
Fourth Children? Is He?

第拾八話 命の選択を
God's in His Heaven,

第拾九話 男の戰い
All's right with the world.

第弐拾話 心のかたち 人のかたち
Weaving a Story:Second Stage

第弐拾壱話 ネルフ、誕生
A White Room

第弐拾弐話 せめて、人間らしく
I'm not human being.

第弐拾参話 涙
Where is Rei's heart?

第弐拾四話 最後のシ者
The Beginning of the End, with "False Seventeen-Angel"

= 「  ひとつ の 終わり  [End of the Stories] 編 =

第弐拾伍話 終わる世界
The Broken-World in the "Air"

第弐拾六話 まごころを、君に
Take care of Yourself. because We have never seen the End.

最終話 欺瞞の終わり
The All Truth of the World.